Menceritakan tentang Koyomi Araragi yang merupakan siswa kelas 3 SMA yang berhasil bertahan dari serangan vampir dengan bantuan Meme Oshino, seorang pria asing yang tinggal di bangunan yang ditinggalkan. Karena terkena serangan vampir, Koyomi sekarang memiliki kekuatan dari setengah vampir yaitu regenerasi dan penglihatan yang sempurna. Apapun yang terjadi, Koyomi tetap ingin menjalani kehidupan sekolahnya seperti biasa dengan bantuan temannya Tsubasa Hanekawa.
Suatu hari saat sedang berjalan di tangga, Koyomi menangkap seorang wanita yang jatuh dari tangga tersebut. Wanita itu adalah Hitagi Senjougahara. Namun yang anehnya, saat Koyomi menangkap wanita itu, Senjougahara tidak memiliki berat badan. Senjougahara yang melihat Koyomi mengetahui rahasianya itu, mulai mengancam Koyomi agar tidak membeberkan rahasianya itu. Namun Koyomi malah berniat untuk menolong Senjougahara, Koyomi memutuskan untuk membawa Senjougahara kepada Oshino, pria yang pernah membantunya dulu.
Melalui beberapa kisah yang melibatkan setan dan dewa. Bakemonogatari mengikuti Koyomi Araragi dalam membantu siapa saja yang terkena penyakit supernatural.
